Narzędzia dydaktyczne · WMed PWr

Studenci Wydziału Medycznego Politechniki Wrocławskiej zyskali nowe narzędzie do nauki — Atlas Skanów. Bezpłatna platforma dostępna pod adresem atlas.wmed.pwr.edu.pl daje dostęp do 115 wysokorozdzielczych preparatów histologicznych z dowolnego miejsca i urządzenia. Za projektem stoją trzy lata pracy, pasja i przekonanie, że medycyna i technologia naprawdę mogą iść w parze.

Mikroskop badawczy Olympus w pracowni histologii WMed PWr

Mikroskop w kieszeni

Histologia to jeden z najtrudniejszych sprawdzianów na pierwszych latach studiów medycznych. Studenci muszą umieć rozpoznać preparaty pod mikroskopem — i to właśnie to rozpoznanie jest warunkiem dopuszczenia do egzaminu teoretycznego. Dotychczas możliwości samodzielnej nauki były poważnie ograniczone: preparaty dostępne były wyłącznie w pracowni, w ściśle określonych godzinach zajęć.

Platforma gromadzi 115 preparatów podzielonych na dwie kategorie: Histologię Ogólną i Histologię Szczegółową. Każdy preparat można przeglądać w bardzo dużym powiększeniu — bez utraty jakości, na laptopie, tablecie lub telefonie. Studenci mogą wracać do materiału w domu, w kawiarni, w tramwaju — kiedy i jak chcą.

Szklane preparaty histologiczne gotowe do skanowania

Rok od pomysłu do uruchomienia

Za projektem stoi duet: dr hab. Mirosław Sopel, prof. uczelni, odpowiedzialny za stronę merytoryczną, dobór preparatów, skanowanie i opisy, oraz Mateusz Kozera, informatyk i programista WMed PWr, który napisał kod platformy. Zaczynali od zera — bez gotowych wzorców i bez wcześniejszych doświadczeń z tego typu projektem.

Od pierwszego pomysłu do uruchomienia wersji beta minął 1 rok. Pół roku zajęła praca nad platformą, a kolejne pół roku pochłonęły formalności organizacyjno-administracyjne. Atlas trafił do studentów tuż przed sesją egzaminacyjną — celowo, żeby mogli skorzystać z niego przy przygotowaniach do egzaminu praktycznego z histologii.

Ładowanie preparatu do skanera Olympus Slideview VS200

Tysiące zdjęć w jednym preparacie

Za każdym skanem kryje się ogromna praca techniczna. Skaner Olympus Slideview VS200 wykonuje tysiące zdjęć pojedynczego szkiełka — jeden preparat to nawet 3 944 osobne ujęcia, które komputer składa w jedno spójne zdjęcie o rozdzielczości nawet 34 933 × 23 403 pikseli. Dla porównania: standardowe zdjęcie z telefonu ma około 12 megapikseli. Jeden taki skan waży nawet 35 GB.

Żeby tak duże pliki działały płynnie na każdym urządzeniu, platforma korzysta z systemu kafelkowania — podobnego mechanizmu do tego, który znamy z map Google. Użytkownik widzi tylko ten fragment obrazu, który aktualnie ogląda; reszta wczytuje się w tle, w miarę potrzeby.

Całą infrastrukturę — serwery, pamięć i sieć — zapewnia Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe (WCSS), dzięki któremu platforma jest dostępna dla studentów bezpłatnie.

Wnętrze skanera Olympus Slideview VS200

Co dalej?

Obecna wersja to Open Beta — platforma działa, ale twórcy aktywnie zbierają feedback od studentów i na bieżąco wprowadzają poprawki. Wkrótce do studentów trafi ankieta, której wyniki posłużą do dopracowania interfejsu. Jeśli odbiór okaże się pozytywny, w planach jest wersja 2.0 z nowymi funkcjami: możliwością rysowania bezpośrednio po preparatach i zapisywania własnych notatek.

W dalszej perspektywie twórcy myślą o rozszerzeniu platformy o zdjęcia radiologiczne i obrazy USG — ten sam schemat działania, zupełnie nowe dziedziny.

Atlas Skanów dostępny jest wyłącznie dla studentów Politechniki Wrocławskiej, w sieci uczelnianej lub przez połączenie VPN. To świadomy wybór twórców — narzędzie ma być wyróżnikiem i przywilejem studentów Wydziału Medycznego PWr.

Atlas Skanów dostępny jest pod adresem: atlas.wmed.pwr.edu.pl (dostęp z sieci PWr lub przez VPN)