Laboratorium umożliwia prowadzenie wielokierunkowych badań związanych z wykrywaniem, identyfikacją oraz analizą białek przy użyciu metod immunologicznych. Techniki te opierają się na swoistym wiązaniu przeciwciała z antygenem. Dzięki temu możliwe jest bardzo dokładne określenie obecności wybranego białka, jego ilości, a także lokalizacji w komórkach lub tkankach. Immunodetekcja białek może być wykorzystana w eksperymentach z zakresu m.in. medycyny, diagnostyki laboratoryjnej, farmacji, biologii molekularnej, immunologii oraz biotechnologii. W laboratorium mogą być prowadzone analizy nowych leków, biomarkerów chorobowych oraz procesów zachodzących w komórkach.

Najważniejszą stosowaną metodą badawczą jest Western Blot (WB). Technika ta umożliwia wykrywanie konkretnych białek w mieszaninie wielu różnych białek. WB wykorzystywany jest głównie do analizy ekspresji białek oraz potwierdzania obecności określonych markerów biologicznych. Ponadto w laboratorium prowadzone mogą być testy immunoenzymatyczne ELISA oraz oznaczenia metodami immunofluorescencji.

Wyposażenie kluczowe:

• Aparat do elektroforezy żelowej pionowej i poziomej Mini-Protean Tetra System i Sub-Cell GT z zasilaczem PowerPac HC (Bio-Rad).
• Aparat do szybkiego transferu białek Trans-Blot Turbo (Bio-Rad).
• System do wizualizacji żeli ChemiDoc MP (Bio-Rad).
• Homogenizator ultradźwiękowy (sonikator) UP100H.
• Homogenizator VWR Bead Mill Max.
• Waga analityczna.
• Wirówka laboratoryjna.
• Wytrząsarka typu „vortex".
• Mieszadło horyzontalne.
• Pipety automatyczne.
• Dygestorium.
• Lodówka i zamrażarka laboratoryjna.
• Szafa na odczynniki chemiczne.

Pracownicy:

dr n. med. Maciej Danielewski

dr hab. n. med. Aleksandra Kuzan, prof. uczelni

dr n. med. Jakub Szyller

mgr Ewa Dejnaka

Laboratorium umożliwia prowadzenie podstawowych i zaawansowanych wieloprofilowych analiz biochemicznych z wykorzystaniem metod klasycznych, komercyjnych i rozwiązań typu „in-house". Możliwa jest realizacja eksperymentów z wykorzystaniem:

• Testów biochemicznych punktu końcowego i kinetycznych.
• Pomiarów stężenia kwasów nukleinowych i białek.
• Pomiarów czasowo-rozdzielczego rezonansowego transferu energii fluorescencji (FRET).
• Badania polaryzacji fluorescencji i interakcji między cząsteczkami (wykorzystanie m.in. w projektach poszukujących związków-kandydatów na związki lecznicze).
• Pomiarów wzrostu mikroorganizmów.
• Badań kinetyki enzymów.
• Badań agregacji płytek krwi i agregacji białek.
• Badań reaktywnych form tlenu (RFT) m.in. przy użyciu sond fluorescencyjnych.
• Analizy zawartości nano- i mikroplastiku w próbkach biologicznych.

Wyposażenie kluczowe:

• Zaawansowany czytnik wielodetekcyjny BioTek Synergy H1 (Agilent).
• Luminex 200 (xMAP® Technology) - system do analiz multiplex. Producent: Luminex Corporation/ThermoFisher Scientific.
• Średnioprzepustowa wirówka laboratoryjna z kompletem rotorów (21 000 x g, Eppendorf).
• Liofilizator CHRIST Alpha 2-4 LSCbasic (Christ®).
• Wirówki MiniSpin z kompletem rotorów (Eppendorf).
• Stacja pipetująca Myra (Bio Molecular Systems).
• Wytrząsarka typu „vortex".
• Mieszadło magnetyczne z płytą grzejną.
• Mieszadło horyzontalne.
• Łaźnia wodna.
• Dygestorium.
• Szafa na odczynniki chemiczne.
• Przepływowe lampy UV.

Pracownicy:

dr n. med. Maciej Danielewski

dr hab. n. med. Aleksandra Kuzan, prof. uczelni

dr n. med. Jakub Szyller

mgr Ewa Dejnaka

W ramach laboratorium funkcjonuje interdyscyplinarna Grupa Badawcza Kardiologii Molekularnej i Środowiskowej (Molecular and Environmental Cardiology Research Group), która koncentruje się m.in. na badaniach wpływu stresu oksydacyjnego i układu immunologicznego na funkcjonowanie układu sercowo-naczyniowego (szczególnie z uwzględnieniem zaburzeń rytmu serca, elektrofizjologii i elektroimmunologii), a także na badaniach nano- i mikroplastiku w układach biologicznych.

Skład grupy:

• mgr inż. Beata Borysiuk
• dr n. med. Maciej Danielewski
• mgr inż. Anna Licznerska
• mgr inż. Adrianna Pyra
• dr n. med. Jakub Szyller

Laboratorium umożliwia prowadzenie wielokierunkowych badań z zakresu farmakogenetyki, farmakogenomiki i biologii molekularnej na potrzeby projektów naukowych, badań klinicznych oraz współpracy międzywydziałowej w ramach Politechniki Wrocławskiej. W laboratorium możliwe jest między innymi prowadzenie reakcji PCR z detekcją w czasie rzeczywistym, analiz jakościowych i ilościowych (oznaczenie liczby kopii produktu), badania ekspresji genów, polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNPs), mikroRNA (miRNA), analiz mutacji oraz zmian liczby kopii genów (CNV), a także analiz kardiogenetycznych.

W Laboratorium możliwe jest prowadzenie analiz szczegółowych z zakresu:

• Badania wariantów genetycznych związanych z metabolizmem i skutecznością działania leków (profili metabolicznych).
• Ilościowej analizy ekspresji genów, genotypowania oraz detekcji mutacji.
• Mechanizmów molekularnych w modelach przedklinicznych.
• Transkryptomiki oraz badań nad heterogennością komórkową w próbkach klinicznych.
• Medycyny spersonalizowanej.
• Badań kardiogenetycznych (ze szczególnym uwzględnieniem zaburzeń rytmu serca), predyspozycji do wystąpienia arytmii zagrażających życiu i odpowiedzi na leczenie farmakologiczne.
• Badania biomarkerów nowotworowych, metabolicznych i innych chorób cywilizacyjnych.

Wyposażenie kluczowe:

• Termocykler real-time-PCR.
• Aparat do elektroforezy żelowej pionowej i poziomej z zasilaczem (Bio-Rad).
• System do wizualizacji żeli chemidoc MP (Bio-Rad).
• Wirówki minispin z kompletem rotorów (Eppendorf).
• Spektrofotometr UV-VIS nanodrop One/One C (ThermoFisher).
• Zaawansowany czytnik wielodetekcyjny biotek Synergy H1 (Agilent).
• Aparat do izolacji kwasów nukleinowych King Fisher Thermo.
• Zautomatyzowany system do elektroforezy kapilarnej (Tape Station).
• Płyta grzejna z regulatorem temperatury.
• Łaźnia wodna.
• Dygestorium.
• Szafa na odczynniki chemiczne.
• Przepływowe lampy UV.
• Lampa UV z promiennikiem.

Pracownicy:

dr n. med. Jakub Szyller

mgr Ewa Dejnaka

prof. dr hab. n. med. Tomasz Sozański

Laboratorium Translacyjnych Modeli In Vitro 2D i 3D zostało zaprojektowane i wyposażone z myślą o prowadzeniu dydaktyki oraz zaawansowanych prac badawczych z zakresu farmakologii eksperymentalnej na poziomie komórkowym, biologii molekularnej, medycyny translacyjnej oraz inżynierii tkankowej. Infrastruktura laboratorium umożliwia realizację projektów naukowych obejmujących zarówno klasyczne hodowle komórkowe, jak i zaawansowane modele trójwymiarowe, w tym sferoidy i organoidy, wykorzystywane do modelowania procesów fizjologicznych i patologicznych oraz badań przedklinicznych.

Laboratorium spełnia wymagania bezpieczeństwa biologicznego poziomu BSL-2, umożliwiając pracę z ludzkim i zwierzęcym materiałem biologicznym. Prowadzone badania koncentrują się na poznawaniu komórkowych i molekularnych mechanizmów rozwoju chorób, identyfikacji potencjalnych celów terapeutycznych oraz ocenie skuteczności i bezpieczeństwa substancji biologicznie czynnych. Szczególne miejsce zajmują badania związków pochodzenia naturalnego oraz nowych związków syntetycznych mogących znaleźć zastosowanie w profilaktyce i leczeniu chorób cywilizacyjnych.

W laboratorium rozwijane są modele badawcze wykorzystywane między innymi w badaniach nad insulinoopornością, cukrzycą typu 2, otyłością, miażdżycą, przewlekłym stanem zapalnym, procesami starzenia oraz zaburzeniami funkcji śródbłonka naczyniowego. Rozwijane modele komórkowe i tkankowe pozwalają ocenić wpływ badanych substancji na ekspresję genów, szlaki przekazywania sygnałów komórkowych, funkcję mitochondriów, stres oksydacyjny oraz procesy zapalne odgrywające istotną rolę w patogenezie chorób przewlekłych.

Laboratorium stwarza warunki do prowadzenia badań translacyjnych łączących osiągnięcia biologii molekularnej, farmakologii i medycyny eksperymentalnej z ich potencjalnym wykorzystaniem w diagnostyce, profilaktyce i terapii chorób człowieka.

Wyposażenie kluczowe:

• Dwie komory laminarne klasy II (Thermo Scientific MaxiSafe 2030i oraz MSC Advantage): zapewniają sterylne warunki pracy z materiałem biologicznym, jedna z nich umożliwia pracę z cytostatykami. Każda z komór wyposażona jest w niezależny system filtracji HEPA, oświetlenie LED oraz gniazda do podłączenia sprzętu pomocniczego. Dzięki podwójnemu stanowisku możliwe jest wykonywanie izolacji materiału biologicznego oraz prowadzenie eksperymentów bez ryzyka kontaminacji.
• Inkubatory CO₂:
  • Inkubator standardowy (Thermo Scientific Forma™ Steri-Cycle™ i160): przeznaczony do klasycznych hodowli komórek adherentnych i zawiesinowych w kontrolowanych warunkach (37°C, 5% CO₂, wysoka wilgotność) z możliwością hodowli w hipoksji.
  • Inkubator do hodowli 3D (Cellvivo Clinostar 2): specjalistyczne urządzenie przystosowane do hodowli przestrzennych, z funkcją dynamicznego mieszania i regulacji parametrów mikrośrodowiska (np. O₂), co umożliwia rozwój sferoidów i organoidów.
• Mikroskop fluorescencyjny (Olympus BX53 z kamerą Olympus DP74) z obiektywami plan fluorytowymi 4x, 10x, 20x, 40x, 60x oraz 100x immersyjny oraz obiektywy 10x, 20x, 40x i 100x do kontrastu fazowego oraz obiektywy 4x, 10x, 20x do techniki ciemnego pola; możliwe jest również wykorzystanie skanera Olympus SlideView VS200, który umożliwia obrazowanie w formacie Whole-Slide Image (WSI).

Wyposażenie uzupełniające:

• JuLI™ Stage - w pełni zautomatyzowany system obrazowania komórek w czasie rzeczywistym, który bezpośrednio pozyskuje obrazy komórek z licznych płytek hodowlanych (od 6 do 384 dołków) i naczyń w inkubatorze; obsługuje wielokanałowe kolory fluorescencyjne (GFP, RFP, DAPI) oraz soczewki wieloobiektywowe (4X, 10X i 20X), a czuła optyka oparta na filtrach jest zoptymalizowana pod kątem badań na żywych komórkach.
• Mikroskop odwrócony z kamerą Leica Mateo z kanałami fluorescencji (Mateo FL) - umożliwia monitorowanie morfologii komórek i dokumentację mikroskopową, w tym pomiar konfluencji, zliczanie komórek, ocena efektywności transfekcji.
• Automatyczny licznik komórek Eve PLUS - przeznaczony do pomiaru liczby i żywotności komórek przy użyciu standardowej techniki trypan blue, z automatycznym ustawianiem ostrości; pomiar parametrów: liczba komórek całkowitych, żywych, martwych, procent żywotności, stężenie i rozmiar komórek.
• Czytnik wielodetekcyjny BioTek Synergy H1 (Agilent).
• Wirówka laboratoryjna – do przygotowywania zawiesin komórkowych oraz izolacji frakcji komórkowych.
• Autoklaw – zapewnia sterylizację szkła laboratoryjnego i sprzętu wielokrotnego użytku.
• Zestawy do mrożenia komórek i przechowywania w ciekłym azocie: 2 dewary, zamrażarka -150°C, dwie zamrażarki -80°C.
• Przepływowe lampy UV oraz lampa UV z promiennikiem.
• Łaźnia wodna, płyta grzewcza z mieszadłem, pipety automatyczne, zbiorniki na odpady biologiczne – standardowe elementy stanowiska pracy w kulturach komórkowych.

Pracownicy:

dr hab. n. med. Aleksandra Kuzan, prof. uczelni

mgr Ewa Dejnaka

prof. dr hab. n. med. Tomasz Sozański